在数字病理和生命科学的研究中，切片扫描仪已成为实现组织样本数字化的关键工具。所谓“切片扫描层数"，其实指的是扫描仪在扫描玻璃切片时，在垂直方向（Z轴）上拍摄的图像层数。这些层数可以提供不同焦深的图像，有助于获得更加清晰、立体的信息，也常用于三维重建或深度学习应用。

一、扫描层数的基本原理

切片扫描层数，来源于“Z-stack扫描"技术。玻璃切片虽然看似二维，但由于样本厚度不一致，加上组织结构复杂，有时候单层聚焦难以涵盖所有重要细节。为此，扫描仪会以设定的步长（比如每次上下移动0.5微米）在垂直方向逐层移动焦点，每一层聚焦拍摄一张图像，从而构建出一个具有深度信息的图像组，这就是“Z层扫描"。

例如：

设置的扫描厚度为5微米；

步长为0.5微米；

那么一共拍摄了11张图像；

这就表示扫描层数为11。

二、扫描层数怎么看——从设备和软件角度

1. 在扫描仪操作界面中查看

不同品牌的切片扫描仪在进行Z-stack扫描时，一般会在操作界面提供扫描参数的设置与显示。例如：

设置Z-stack时，会显示总厚度和步长；

设备会自动计算出总层数（Total Layers）；

部分设备在扫描完毕后，图像信息栏中会显示“扫描层数"或“Z-layers"字段。

2. 在图像浏览软件中查看

完成扫描后，用户可以通过专业图像浏览或分析软件查看切片的图层信息。这些软件通常支持Z轴浏览，即在不同聚焦层之间进行切换。

常见软件包括：

CaseViewer（用于3DHISTECH）；

NDP.view2（用于Hamamatsu）；

ImageScope（用于Leica Aperio）；

Motic DSAssistant（用于Motic EasyScan）；

QuPath 或 ImageJ（适用于通用格式）；

进入图像后，在“图像属性"、“图层导航器"或右下角的Z轴滚动栏中，都可以查看当前总层数和当前位置。例如，滚动条显示为“Layer 5 of 11"，即第5层，共11层。

3. 查看图像文件结构

数字切片的文件格式如 .ndpi、.svs、.czi、.tif 等，许多支持多层嵌套。可以使用以下方法判断层数：

打开切片文件时，图像查看器会识别是否为Z-stack图像；

某些软件能显示每一层的缩略图；

如果将切片图像导出为图像序列（如一层一张TIFF图），文件数量就是扫描层数。

三、为什么要关注扫描层数

获取清晰图像：不同组织深度的细节可能不在同一焦平面上，使用多层图像可以解决聚焦不清的问题。

辅助三维重建：某些软件可以将Z-stack图像用于3D建模，尤其适合神经元追踪、血管结构重构等。

提高AI识别准确率：AI模型在训练和识别过程中，使用多层图像能获取更全面的特征。

四、注意事项和建议

不是所有设备都支持Z-stack：部分低端或老型号扫描仪只能进行单层扫描。

扫描层数过多数据量庞大：层数多意味着数据量增大，存储和处理成本更高。应根据实际需求设定。

扫描前需根据组织厚度设定合适参数：厚组织建议扫描多层，薄切片可以选择单层或少层。

五、实际操作建议

扫描前规划参数：

判断是否需要Z-stack；

设定好Z方向总厚度和每层步长；

软件会自动显示预计层数。

查看图像时切换层数：

利用滚轮、滑条或“上一层/下一层"按钮，切换层面；

检查目标区域在不同层上的聚焦情况。

导出图像时保留层信息：

若需分析或备份，应选择导出Z-stack图像序列而非单层合成图。

六、总结

切片扫描中的“层数"，本质上是数字化图像获取在Z轴方向上的延伸，是现代数字病理中获取立体清晰图像的重要手段。用户可以通过设备界面、专业软件、图像导出等方式查看扫描层数，从而掌握切片的完整图像信息。在应用中合理设定层数、科学使用Z-stack功能，不仅能提升图像质量，也能为后续的临床分析、科研研究、AI开发打下坚实基础。